Tom Fernández nació en Oviedo. Empezó trabajando como guionista para la conocida serie televisiva Siete vidas. Durante este época conoció a Javier Cámara, al que ha elegido como protagonista en sus películas más personales, la primera de ellas La torre de Suso. También con él rodó ¿Para qué sirve un oso?
Dentro de su faceta como guionista ha trabajado en otras series de televisión españolas como A medias o El chiringuito de Pepe.
Ha dirigido varios documentales, como Trashumancia y en 2002 Tom Fernández hizo su primera incursión en el mundo del teatro dirigiendo y escribiendo el libreto de la obra Madre no hay más que una.